Un phénomène étrange appelé “séisme spatial“ dévaste le centre de l'Eurasie,
faisant au moins 150 millions de victimes.
Au cours des 30 prochaines années, de petits séismes
spatiaux envahissent le monde de manière irrégulière.

Dans le présent, Itsuka Shido est un lycéen ordinaire pas doué avec les filles.
Le premier jour de cours, un tremblement d'espace détruit la ville
et une fille dotée d'une armure apparaît en face de lui.
Pris dans une violente bataille, notre héros se retrouve inconscient, lors de son réveil
il se retrouve dans un vaisseau et apprend que Kotori, sa soeur, en est le capitaine.